Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms