Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRJQ12913 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRJQ12913 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRJQ12913 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRJQ12913 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRJQ12913 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRJQ12913 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRJQ12913 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PTPRJQ12913 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPRJQ12913 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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