Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPTBN1Q01082 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms