Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFNP31947 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFNP31947 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms