Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HKR1P10072 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HKR1P10072 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HKR1P10072 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HKR1P10072 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HKR1P10072 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HKR1P10072 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms