Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms