Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RAB9BQ9NP90 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms