Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM6Q9C030 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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