Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms