Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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