RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.16■■□□□ 1.78
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PTPRN-202ENST00000409251 NESP48681 1621 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
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PTPRN-202ENST00000409251 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRN-202ENST00000409251 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.81■□□□□ 0.6
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PTPRN-202ENST00000409251 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
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