Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZSCAN31-201ENST00000344279 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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LSAMPQ13449 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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LSAMPQ13449 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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LSAMPQ13449 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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LSAMPQ13449 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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