Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms