Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RNF7Q9UBF6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RNF7Q9UBF6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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