Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms