Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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