Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMAN1P49257 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMAN1P49257 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LMAN1P49257 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LMAN1P49257 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347.1 ms