Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCLCP48506 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCLCP48506 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms