Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RANGAP1P46060 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms