Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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