Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ACADSBP45954 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms