Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF24Q9UPV7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms