Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms