Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SRSF12Q8WXF0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SRSF12Q8WXF0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms