Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP46P62068 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP46P62068 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP46P62068 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP46P62068 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP46P62068 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP46P62068 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP46P62068 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP46P62068 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP46P62068 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP46P62068 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP46P62068 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP46P62068 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP46P62068 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP46P62068 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP46P62068 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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USP46P62068 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USP46P62068 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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