Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms