Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP13Q92995 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms