Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALD1Q05682 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms