Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC27Q2M243 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms