Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CCDC142Q17RM4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CCDC142Q17RM4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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CCDC142Q17RM4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CCDC142Q17RM4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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CCDC142Q17RM4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC142Q17RM4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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