Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms