Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NDPQ00604 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NDPQ00604 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NDPQ00604 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NDPQ00604 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NDPQ00604 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms