Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
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