Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BP0C0L5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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