RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471553.1

AC004969.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC004969.1, Length 578 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004969.1-201ENST00000471553 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.84■■■□□ 2.69
AC004969.1-201ENST00000471553 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
AC004969.1-201ENST00000471553 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.16■■■□□ 2.1
AC004969.1-201ENST00000471553 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.87■■■□□ 2.05
AC004969.1-201ENST00000471553 ABCC9O60706 1549 aa27.36■■□□□ 1.97
AC004969.1-201ENST00000471553 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
AC004969.1-201ENST00000471553 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.46■■□□□ 1.83
AC004969.1-201ENST00000471553 NACADO15069 1562 aa26.46■■□□□ 1.83
AC004969.1-201ENST00000471553 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.41■■□□□ 1.82
AC004969.1-201ENST00000471553 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.4■■□□□ 1.82
AC004969.1-201ENST00000471553 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.37■■□□□ 1.81
AC004969.1-201ENST00000471553 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.74■■□□□ 1.71
AC004969.1-201ENST00000471553 SCRIBQ14160 1630 aa25.73■■□□□ 1.71
AC004969.1-201ENST00000471553 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
AC004969.1-201ENST00000471553 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.61■■□□□ 1.69
AC004969.1-201ENST00000471553 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
AC004969.1-201ENST00000471553 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
AC004969.1-201ENST00000471553 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.93■■□□□ 1.58
AC004969.1-201ENST00000471553 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
AC004969.1-201ENST00000471553 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
AC004969.1-201ENST00000471553 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.78■■□□□ 1.56
AC004969.1-201ENST00000471553 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.75■■□□□ 1.55
AC004969.1-201ENST00000471553 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
AC004969.1-201ENST00000471553 SMARCA4P51532 1647 aa24.64■■□□□ 1.53
AC004969.1-201ENST00000471553 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.54■■□□□ 1.52
AC004969.1-201ENST00000471553 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.48■■□□□ 1.51
AC004969.1-201ENST00000471553 SMARCA2P51531 1590 aa24.43■■□□□ 1.5
AC004969.1-201ENST00000471553 NCAPD3P42695 1498 aa24.43■■□□□ 1.5
AC004969.1-201ENST00000471553 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.42■■□□□ 1.5
AC004969.1-201ENST00000471553 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
AC004969.1-201ENST00000471553 HMGXB3Q12766 1538 aa24.31■■□□□ 1.48
AC004969.1-201ENST00000471553 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
AC004969.1-201ENST00000471553 WIZO95785 1651 aa24.24■■□□□ 1.47
AC004969.1-201ENST00000471553 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
AC004969.1-201ENST00000471553 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
AC004969.1-201ENST00000471553 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.76■■□□□ 1.39
AC004969.1-201ENST00000471553 NESP48681 1621 aa23.74■■□□□ 1.39
AC004969.1-201ENST00000471553 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.73■■□□□ 1.39
AC004969.1-201ENST00000471553 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.71■■□□□ 1.39
AC004969.1-201ENST00000471553 CFTRP13569 1480 aa23.64■■□□□ 1.38
AC004969.1-201ENST00000471553 FOXD1Q16676 465 aa23.59■■□□□ 1.37
AC004969.1-201ENST00000471553 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.57■■□□□ 1.36
AC004969.1-201ENST00000471553 ERCC6Q03468 1493 aa23.56■■□□□ 1.36
AC004969.1-201ENST00000471553 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.44■■□□□ 1.34
AC004969.1-201ENST00000471553 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.41■■□□□ 1.34
AC004969.1-201ENST00000471553 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.39■■□□□ 1.34
AC004969.1-201ENST00000471553 PRDM2Q13029 1718 aa23.38■■□□□ 1.33
AC004969.1-201ENST00000471553 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
AC004969.1-201ENST00000471553 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.32■■□□□ 1.32
AC004969.1-201ENST00000471553 CUX2O14529 1486 aa23.25■■□□□ 1.31
AC004969.1-201ENST00000471553 WDR62O43379 1518 aa23.23■■□□□ 1.31
AC004969.1-201ENST00000471553 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AC004969.1-201ENST00000471553 TOPBP1Q92547 1522 aa23.1■■□□□ 1.29
AC004969.1-201ENST00000471553 ABCC8Q09428 1581 aa23.1■■□□□ 1.29
AC004969.1-201ENST00000471553 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.08■■□□□ 1.29
AC004969.1-201ENST00000471553 CUX1P39880 1505 aa23.01■■□□□ 1.27
AC004969.1-201ENST00000471553 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
AC004969.1-201ENST00000471553 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
AC004969.1-201ENST00000471553 IFT140Q96RY7 1462 aa22.91■■□□□ 1.26
AC004969.1-201ENST00000471553 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.89■■□□□ 1.25
AC004969.1-201ENST00000471553 SYNJ1O43426 1573 aa22.86■■□□□ 1.25
AC004969.1-201ENST00000471553 TOP2BQ02880 1626 aa22.86■■□□□ 1.25
AC004969.1-201ENST00000471553 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.83■■□□□ 1.25
AC004969.1-201ENST00000471553 SOGA1O94964 1423 aa22.82■■□□□ 1.24
AC004969.1-201ENST00000471553 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.81■■□□□ 1.24
AC004969.1-201ENST00000471553 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
AC004969.1-201ENST00000471553 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
AC004969.1-201ENST00000471553 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.7■■□□□ 1.22
AC004969.1-201ENST00000471553 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
AC004969.1-201ENST00000471553 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
AC004969.1-201ENST00000471553 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
AC004969.1-201ENST00000471553 WDR97A6NE52 1622 aa22.66■■□□□ 1.22
AC004969.1-201ENST00000471553 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.57■■□□□ 1.2
AC004969.1-201ENST00000471553 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.56■■□□□ 1.2
AC004969.1-201ENST00000471553 TRIM41Q8WV44 630 aa22.54■■□□□ 1.2
AC004969.1-201ENST00000471553 GRIN2BQ13224 1484 aa22.54■■□□□ 1.2
AC004969.1-201ENST00000471553 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.48■■□□□ 1.19
AC004969.1-201ENST00000471553 KIF27Q86VH2 1401 aa22.46■■□□□ 1.19
AC004969.1-201ENST00000471553 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
AC004969.1-201ENST00000471553 PBRM1Q86U86 1689 aa22.44■■□□□ 1.18
AC004969.1-201ENST00000471553 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.41■■□□□ 1.18
AC004969.1-201ENST00000471553 SYNJ2O15056 1496 aa22.35■■□□□ 1.17
AC004969.1-201ENST00000471553 IGF1RP08069 1367 aa22.35■■□□□ 1.17
AC004969.1-201ENST00000471553 ADAMTS12P58397 1594 aa22.34■■□□□ 1.17
AC004969.1-201ENST00000471553 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.33■■□□□ 1.17
AC004969.1-201ENST00000471553 FBLN2P98095 1184 aa22.32■■□□□ 1.16
AC004969.1-201ENST00000471553 OSCARQ8IYS5 282 aa22.32■■□□□ 1.16
AC004969.1-201ENST00000471553 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
AC004969.1-201ENST00000471553 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.31■■□□□ 1.16
AC004969.1-201ENST00000471553 CHD1O14646 1710 aa22.29■■□□□ 1.16
AC004969.1-201ENST00000471553 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.26■■□□□ 1.15
AC004969.1-201ENST00000471553 GRIN2AQ12879 1464 aa22.24■■□□□ 1.15
AC004969.1-201ENST00000471553 CUL7Q14999 1698 aa22.23■■□□□ 1.15
AC004969.1-201ENST00000471553 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.21■■□□□ 1.15
AC004969.1-201ENST00000471553 EEA1Q15075 1411 aa22.19■■□□□ 1.14
AC004969.1-201ENST00000471553 NUP160Q12769 1436 aa22.16■■□□□ 1.14
AC004969.1-201ENST00000471553 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.13■■□□□ 1.13
AC004969.1-201ENST00000471553 CEP170Q5SW79 1584 aa22.12■■□□□ 1.13
AC004969.1-201ENST00000471553 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.11■■□□□ 1.13
AC004969.1-201ENST00000471553 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms