Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGA4Q9Y5G9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHGA4Q9Y5G9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHGA4Q9Y5G9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms