Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F3

PCDHB1, Protocadherin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB1Q9Y5F3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHB1Q9Y5F3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB1Q9Y5F3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms