Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSPAN16Q9UKR8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN16Q9UKR8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms