Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCHIP1Q9P0W5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCHIP1Q9P0W5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms