Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TLR7Q9NYK1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TLR7Q9NYK1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TLR7Q9NYK1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TLR7Q9NYK1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TLR7Q9NYK1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TLR7Q9NYK1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TLR7Q9NYK1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TLR7Q9NYK1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TLR7Q9NYK1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms