Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXD4L1Q9NU39 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXD4L1Q9NU39 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms