Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms