Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.151e-9■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.131e-9■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 PRAME-209ENST00000439106 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.33■■□□□ 13e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.913e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.883e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 PRAME-207ENST00000420709 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.24■□□□□ 0.833e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.663e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.63e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.583e-13■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 30.1
DROSHAQ9NRR4 SHANK2-207ENST00000425049 557 ntTSL 425.44■■□□□ 1.668e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 SHANK2-213ENST00000460048 736 ntTSL 525.38■■□□□ 1.658e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 418.73■□□□□ 0.598e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 SHANK2-214ENST00000468619 2775 ntTSL 218.09■□□□□ 0.498e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.118e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 PTK2-203ENST00000430260 1940 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.38e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 PTK2-253ENST00000523805 440 ntTSL 312.56□□□□□ -0.48e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 PTK2-221ENST00000520460 572 ntTSL 411.72□□□□□ -0.538e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.258e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.74□□□□□ -2.138e-9■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 224.24■■□□□ 1.475e-18■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 30
DROSHAQ9NRR4 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 429.12■■■□□ 2.253e-6■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.723e-6■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)19.93■□□□□ 0.785e-8■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 WDR44-205ENST00000493448 1041 ntTSL 418.19■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.637e-12■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.892e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.712e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-213ENST00000590313 1919 ntTSL 224.86■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 29.9
DROSHAQ9NRR4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.185e-7■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 SATB2-207ENST00000463386 372 ntTSL 417■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 UBALD1-207ENST00000591113 659 ntTSL 534.61■■■■□ 3.137e-7■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.569e-8■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 222.85■■□□□ 1.259e-8■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)20.07■□□□□ 0.89e-8■■■■■ 29.8
DROSHAQ9NRR4 SKIL-208ENST00000477216 554 ntTSL 438.38■■■■□ 3.735e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.89■■■■□ 3.668e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-209ENST00000528719 669 ntTSL 437.72■■■■□ 3.635e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SKIL-205ENST00000465590 594 ntTSL 1 (best)36.64■■■■□ 3.465e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PPP1R37-206ENST00000544069 712 ntTSL 535.92■■■■□ 3.345e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TNK2-210ENST00000433111 580 ntTSL 435.62■■■■□ 3.295e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIGS-213ENST00000583631 546 ntTSL 535.19■■■■□ 3.225e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 BRF1-216ENST00000550208 1040 ntTSL 334.44■■■■□ 3.15e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 UVSSA-205ENST00000507422 670 ntTSL 333.94■■■■□ 3.025e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 533.42■■■□□ 2.945e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM96B-202ENST00000562362 713 ntTSL 333.27■■■□□ 2.925e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 233.18■■■□□ 2.95e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SKIL-207ENST00000476188 607 ntTSL 533.1■■■□□ 2.895e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CPEB1-205ENST00000569257 527 ntTSL 432.94■■■□□ 2.865e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TNK2-220ENST00000486523 300 ntTSL 331.8■■■□□ 2.685e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)31.68■■■□□ 2.665e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.65e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-227ENST00000582725 1127 ntTSL 531.2■■■□□ 2.595e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.575e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TNK2-207ENST00000427576 541 ntTSL 331.05■■■□□ 2.565e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.525e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.465e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 530.35■■■□□ 2.455e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 430.35■■■□□ 2.455e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 230.32■■■□□ 2.445e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.435e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIGS-212ENST00000582721 594 ntTSL 430.19■■■□□ 2.425e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-208ENST00000577696 656 ntTSL 430.15■■■□□ 2.425e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.335e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 229.45■■■□□ 2.315e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.225e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.225e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CPEB1-203ENST00000567678 557 ntTSL 428.78■■■□□ 2.25e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.175e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM96B-206ENST00000569299 708 ntTSL 228.31■■■□□ 2.125e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 U52111.1-202ENST00000416854 244 ntTSL 528.04■■■□□ 2.086e-13■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 527.79■■■□□ 2.045e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PPP1R37-203ENST00000496125 555 ntTSL 327.66■■■□□ 2.025e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-217ENST00000578941 1079 ntTSL 1 (best)27.61■■■□□ 2.015e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-226ENST00000582608 559 ntTSL 427.6■■■□□ 2.015e-7■■■■■ 29.7
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