RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465590.1

SKIL-205, Transcript of SKI like proto-oncogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SKIL, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIL-205ENST00000465590 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.56■■■■■ 6.81
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SKIL-205ENST00000465590 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.02■■■■■ 5.28
SKIL-205ENST00000465590 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
SKIL-205ENST00000465590 NACADO15069 1562 aa47.96■■■■■ 5.27
SKIL-205ENST00000465590 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.94■■■■■ 5.26
SKIL-205ENST00000465590 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.76■■■■■ 5.24
SKIL-205ENST00000465590 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.66■■■■■ 5.22
SKIL-205ENST00000465590 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.79■■■■■ 5.08
SKIL-205ENST00000465590 SCRIBQ14160 1630 aa46.59■■■■■ 5.05
SKIL-205ENST00000465590 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.48■■■■■ 5.03
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SKIL-205ENST00000465590 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.03■■■■■ 4.96
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SKIL-205ENST00000465590 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.95■■■■■ 4.79
SKIL-205ENST00000465590 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.78■■■■■ 4.76
SKIL-205ENST00000465590 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
SKIL-205ENST00000465590 SMARCA4P51532 1647 aa44.6■■■■■ 4.73
SKIL-205ENST00000465590 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.35■■■■■ 4.69
SKIL-205ENST00000465590 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.29■■■■■ 4.68
SKIL-205ENST00000465590 SMARCA2P51531 1590 aa44.28■■■■■ 4.68
SKIL-205ENST00000465590 NCAPD3P42695 1498 aa44.24■■■■■ 4.67
SKIL-205ENST00000465590 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.17■■■■■ 4.66
SKIL-205ENST00000465590 HMGXB3Q12766 1538 aa44.04■■■■■ 4.64
SKIL-205ENST00000465590 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
SKIL-205ENST00000465590 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
SKIL-205ENST00000465590 WIZO95785 1651 aa43.88■■■■■ 4.62
SKIL-205ENST00000465590 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
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SKIL-205ENST00000465590 NESP48681 1621 aa43.05■■■■■ 4.48
SKIL-205ENST00000465590 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.03■■■■■ 4.48
SKIL-205ENST00000465590 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.98■■■■■ 4.47
SKIL-205ENST00000465590 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.94■■■■■ 4.47
SKIL-205ENST00000465590 ERCC6Q03468 1493 aa42.84■■■■■ 4.45
SKIL-205ENST00000465590 CFTRP13569 1480 aa42.77■■■■■ 4.44
SKIL-205ENST00000465590 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.76■■■■■ 4.44
SKIL-205ENST00000465590 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.56■■■■■ 4.4
SKIL-205ENST00000465590 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.47■■■■■ 4.39
SKIL-205ENST00000465590 PRDM2Q13029 1718 aa42.45■■■■■ 4.39
SKIL-205ENST00000465590 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.4■■■■■ 4.38
SKIL-205ENST00000465590 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
SKIL-205ENST00000465590 CUX2O14529 1486 aa42.28■■■■■ 4.36
SKIL-205ENST00000465590 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.28■■■■■ 4.36
SKIL-205ENST00000465590 WDR62O43379 1518 aa42.11■■■■■ 4.33
SKIL-205ENST00000465590 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
SKIL-205ENST00000465590 ABCC8Q09428 1581 aa41.88■■■■■ 4.29
SKIL-205ENST00000465590 TOPBP1Q92547 1522 aa41.81■■■■■ 4.28
SKIL-205ENST00000465590 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
SKIL-205ENST00000465590 CUX1P39880 1505 aa41.59■■■■■ 4.25
SKIL-205ENST00000465590 IFT140Q96RY7 1462 aa41.51■■■■■ 4.24
SKIL-205ENST00000465590 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
SKIL-205ENST00000465590 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
SKIL-205ENST00000465590 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.42■■■■■ 4.22
SKIL-205ENST00000465590 SOGA1O94964 1423 aa41.34■■■■■ 4.21
SKIL-205ENST00000465590 TOP2BQ02880 1626 aa41.33■■■■■ 4.21
SKIL-205ENST00000465590 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
SKIL-205ENST00000465590 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.31■■■■■ 4.2
SKIL-205ENST00000465590 SYNJ1O43426 1573 aa41.3■■■■■ 4.2
SKIL-205ENST00000465590 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.28■■■■■ 4.2
SKIL-205ENST00000465590 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
SKIL-205ENST00000465590 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
SKIL-205ENST00000465590 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.08■■■■■ 4.17
SKIL-205ENST00000465590 WDR97A6NE52 1622 aa41.06■■■■■ 4.16
SKIL-205ENST00000465590 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
SKIL-205ENST00000465590 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.04■■■■■ 4.16
SKIL-205ENST00000465590 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.86■■■■■ 4.13
SKIL-205ENST00000465590 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.83■■■■■ 4.13
SKIL-205ENST00000465590 GRIN2BQ13224 1484 aa40.83■■■■■ 4.13
SKIL-205ENST00000465590 PBRM1Q86U86 1689 aa40.72■■■■■ 4.11
SKIL-205ENST00000465590 TRIM41Q8WV44 630 aa40.71■■■■■ 4.11
SKIL-205ENST00000465590 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.7■■■■■ 4.11
SKIL-205ENST00000465590 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
SKIL-205ENST00000465590 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.65■■■■■ 4.1
SKIL-205ENST00000465590 OSCARQ8IYS5 282 aa40.61■■■■■ 4.09
SKIL-205ENST00000465590 KIF27Q86VH2 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
SKIL-205ENST00000465590 FBLN2P98095 1184 aa40.57■■■■■ 4.09
SKIL-205ENST00000465590 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.57■■■■■ 4.08
SKIL-205ENST00000465590 CHD1O14646 1710 aa40.53■■■■■ 4.08
SKIL-205ENST00000465590 SYNJ2O15056 1496 aa40.52■■■■■ 4.08
SKIL-205ENST00000465590 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
SKIL-205ENST00000465590 ADAMTS12P58397 1594 aa40.43■■■■■ 4.06
SKIL-205ENST00000465590 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.41■■■■■ 4.06
SKIL-205ENST00000465590 IGF1RP08069 1367 aa40.37■■■■■ 4.05
SKIL-205ENST00000465590 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.37■■■■■ 4.05
SKIL-205ENST00000465590 GRIN2AQ12879 1464 aa40.28■■■■■ 4.04
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SKIL-205ENST00000465590 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.24■■■■■ 4.03
SKIL-205ENST00000465590 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.16■■■■■ 4.02
SKIL-205ENST00000465590 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.11■■■■■ 4.01
SKIL-205ENST00000465590 NUP160Q12769 1436 aa40.09■■■■■ 4.01
SKIL-205ENST00000465590 CEP170Q5SW79 1584 aa40.05■■■■■ 4
SKIL-205ENST00000465590 EEA1Q15075 1411 aa40.01■■■■■ 4
SKIL-205ENST00000465590 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.94■■■■□ 3.98
SKIL-205ENST00000465590 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.92■■■■□ 3.98
SKIL-205ENST00000465590 ARHGEF11O15085 1522 aa39.9■■■■□ 3.98
SKIL-205ENST00000465590 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.86■■■■□ 3.97
SKIL-205ENST00000465590 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.86■■■■□ 3.97
SKIL-205ENST00000465590 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.86■■■■□ 3.97
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