Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-203ENST00000518563 719 ntTSL 227.71■■■□□ 2.032e-45■■■■■ 336.9
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-207ENST00000521348 784 ntTSL 513.63□□□□□ -0.232e-45■■■■■ 336.9
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-205ENST00000520115 580 ntTSL 413.41□□□□□ -0.262e-45■■■■■ 336.9
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-209ENST00000522069 625 ntTSL 511.05□□□□□ -0.642e-45■■■■■ 336.9
UTP3Q9NQZ2 VDAC3-202ENST00000518495 531 ntTSL 36.84□□□□□ -1.312e-45■■■■■ 336.9
UTP3Q9NQZ2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.576e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PTH1R-204ENST00000427125 1914 ntTSL 531.1■■■□□ 2.576e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.456e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PTH1R-205ENST00000428220 2063 ntTSL 228.67■■■□□ 2.186e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ATXN7-205ENST00000474513 728 ntTSL 1 (best)27.39■■□□□ 1.986e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.926e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 THSD4-207ENST00000620694 416 ntTSL 326.04■■□□□ 1.766e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.666e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HIRIP3-203ENST00000563680 755 ntTSL 325.1■■□□□ 1.616e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-213ENST00000566631 1633 ntTSL 225.05■■□□□ 1.66e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.586e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.566e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.536e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.526e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.526e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PROCA1-208ENST00000579650 1007 ntTSL 1 (best)24.32■■□□□ 1.486e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 C2orf69-202ENST00000491721 1034 ntTSL 223.96■■□□□ 1.436e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.46e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 TRDMT1-211ENST00000495022 1374 ntTSL 223.78■■□□□ 1.45e-18■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PLPBP-202ENST00000518036 558 ntTSL 423.54■■□□□ 1.366e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.366e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 FGFR1OP-203ENST00000476078 682 ntTSL 323.44■■□□□ 1.346e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.36e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-206ENST00000564029 942 ntTSL 522.94■■□□□ 1.266e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.266e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.246e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.226e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-207ENST00000440176 1328 ntTSL 222.32■■□□□ 1.166e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SNX27-202ENST00000368841 7070 ntTSL 1 (best)22.14■■□□□ 1.136e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HSPG2-205ENST00000427897 589 ntTSL 522.02■■□□□ 1.126e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.116e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CD320-205ENST00000598299 577 ntTSL 221.91■■□□□ 1.16e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.094e-8■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.086e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.076e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.076e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-203ENST00000411549 1944 ntTSL 1 (best)21.55■■□□□ 1.046e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.046e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF18-205ENST00000599752 582 ntTSL 321.38■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 521.36■■□□□ 1.016e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-206ENST00000423611 877 ntTSL 321.34■■□□□ 1.016e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 16e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-204ENST00000418880 737 ntTSL 321.16■□□□□ 0.986e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.977e-40■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.946e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.926e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PLPBP-207ENST00000523358 516 ntTSL 220.76■□□□□ 0.916e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PLPBP-206ENST00000523187 569 ntTSL 320.75■□□□□ 0.916e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PLPBP-209ENST00000523994 559 ntTSL 320.75■□□□□ 0.916e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 EFHD2-202ENST00000445566 899 ntTSL 520.74■□□□□ 0.916e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.916e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.96e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.886e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-209ENST00000521927 814 ntTSL 520.51■□□□□ 0.876e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 HSD17B14-202ENST00000595764 674 ntTSL 520.5■□□□□ 0.876e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.876e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CD320-203ENST00000596002 1729 ntTSL 1 (best)20.42■□□□□ 0.866e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.856e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AIF1L-209ENST00000472942 899 ntTSL 320.23■□□□□ 0.836e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.836e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-11■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.824e-8■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CD320-204ENST00000596246 492 ntTSL 320.11■□□□□ 0.816e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 GOLGA8B-205ENST00000564575 574 ntTSL 420.07■□□□□ 0.86e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 GOLGA8B-208ENST00000567956 533 ntTSL 220.07■□□□□ 0.86e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.86e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.786e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CACNA1E-207ENST00000524607 1795 ntTSL 519.63■□□□□ 0.736e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PLPBP-203ENST00000520073 770 ntTSL 219.61■□□□□ 0.736e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.726e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-243ENST00000592407 509 ntTSL 219.46■□□□□ 0.716e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.76e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-211ENST00000565881 1565 ntTSL 519.4■□□□□ 0.76e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-215ENST00000568210 1717 ntTSL 219.39■□□□□ 0.76e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 RAB43-206ENST00000457077 574 ntTSL 419.3■□□□□ 0.686e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-216ENST00000568273 1711 ntTSL 219.3■□□□□ 0.686e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.686e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.646e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.636e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.616e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MORN1-209ENST00000606372 1960 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.616e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-212ENST00000566479 2715 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.66e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 NACC1-203ENST00000586171 534 ntTSL 518.79■□□□□ 0.66e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CDK11A-209ENST00000460465 2333 ntTSL 1 (best)18.78■□□□□ 0.62e-11■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ABCB6-209ENST00000492543 806 ntTSL 518.74■□□□□ 0.597e-40■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ACAA1-205ENST00000421218 869 ntTSL 518.72■□□□□ 0.596e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 WDR27-206ENST00000474018 951 ntTSL 218.64■□□□□ 0.576e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 CD320-206ENST00000599573 861 ntTSL 218.6■□□□□ 0.576e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-222ENST00000570276 2951 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.566e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 MLKL-206ENST00000575686 567 ntTSL 418.44■□□□□ 0.546e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-214ENST00000540548 187 ntTSL 318.44■□□□□ 0.546e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 BAHCC1-208ENST00000625166 1890 nt18.36■□□□□ 0.536e-14■■■■■ 335.4
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