Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF2Q9HAK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBF2Q9HAK2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms