Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDCA4Q9BXL8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms