Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCM2Q9BSQ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2Q9BSQ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2Q9BSQ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms