Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GINS3Q9BRX5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GINS3Q9BRX5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms