Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF13CQ96RJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms